一、综合科：负责综合协调工作；办理机关日常事务，拟订机关内部管理制度并组织实施；负责文秘、信息、保密、档案、安全、综治、精神文明建设等工作；负责党务、群团、机构编制、人事等工作。

二、现场监督科：负责对进入市政务服务和公共资源交易中心的审批服务事项办理情况以及“一门办情况的督查；负责入驻单位窗口工作人员的日常管理、监督和考核。

三、服务科：（市投资项目联合审批服务中心）。负责入驻单位窗口优质服务、“一网办”“一次办”的统筹和协调；负责入驻单位窗口为企业和群众开展全程代办、协办和上门服务、延时服务、预约服务等“特色服务”的统筹和协调、管理；负责市本级投资项目联合审批、联合踏勘（测试）、联合验收、全程代办服务的组织、统筹、协调、督办工作；负责市本级投资项目全程在线审批监管工作。

四、网管科：负责中心互联网、电子政务内网、电子政务外网的规划、建设和日常维护；负责行政审批系统、电子监察系统、视频监控系统的日常维护、管理；负责入驻单位窗口工作人员的电子化业务培训；负责与省市政务服务和公共资源交易中心“一体化政务平台”的对接工作。

五、财务科：负责财务和国有资产管理工作，指导和监督下属事业单位财务管理工作。

六、机关党委：负责机关和所属单位的党群工作。